Some representative placeholder content for the first slide of the carousel.
Some representative placeholder content for the second slide of the carousel.
Some representative placeholder content for the third slide of this carousel.
Isolez l’ARN bactérien des échantillons mélangés
Pour la séparation et l’isolement de l’ARN bactérien à partir d’échantillons mélangés. Le kit Invitrogen comprend suffisamment de réactifs pour épuiser 500 μg d’ARN de cellule hôte (20 réactions x 25 μg d’ARN) à partir d’un mélange complexe d’ARN bactérien-hôte. L’analyse de l’expression génétique à la suite d’interactions hôte-bactéries révolutionne notre compréhension de la réponse de l’hôte à l’infection bactérienne. De nombreuses études ont utilisé l’analyse de biopuces pour suivre les altérations du transcriptome de la cellule hôte en réponse aux interactions avec les bactéries. Cependant, étant donné qu’aucune méthode n’a été utilisée pour éloigner l’ARN bactérien de l’ARN de la cellule hôte, les analyses correspondantes des transcriptomes bactériens ont été impossibles. Le kit MICROBEnrich™ permet d’analyser l’expression des biopuces de génome entier de l’ARN bactérien après les interactions hôte-bactéries. Commencer avec n’importe quel échantillon d’ARN total Pour l’analyse de biopuces et d’autres applications sensibles, un traitement par DNase est recommandé pour éliminer l’ADN génomique contaminant de l’ARN total avant la procédure du kit MICROBEnrich. Éliminez >90 % de l’ARN de mammifères des mélanges d’ARN totaux complexes Le kit MICROBEnrich utilise la technologie de capture d’hybridation (brevet en attente) pour éliminer l’ARN humain, de souris et de rat (ARNm et ARNr) des populations d’ARN bactérien-hôte complexes, produisant ainsi un ARN total microbien enrichi. Dans la première étape de la procédure, l’ARN total bactérien-hôte est incubé avec un mélange d’oligonucléotides de capture qui lient les ARNr 18S et 28S de mammifères et les ARN polyadénylés. Ensuite, les hybrides de nucléotides d’ARNr / oligonucléotides et tous les ARNm polyadénylés sont éliminés du mélange avec des microbilles magnétiques dérivées d’oligonucléotides. Après la séparation magnétique, l’ARN bactérien restant dans le surnageant peut être précipité avec de l’éthanol. Les ARNm bactériens purifiés avec le kit MICROBEnrich sont de meilleurs modèles que l’ARN total pour les applications en aval et offrent donc des augmentations spectaculaires de sensibilité lorsqu’ils sont utilisés dans des applications telles que l’analyse de réseaux.
Le kit MICROBEnrich fonctionne avec toutes les espèces bactériennes Le kit MICROBEnrich a été optimisé à l’aide de l’ARN d’E. coli dans un contexte d’ARN humain, de souris et de rat. Cependant, le kit devrait bien fonctionner avec de l’ARN provenant de toutes les espèces bactériennes. Bien que de nombreuses espèces hôtes de mammifères puissent être compatibles avec le kit MICROBEnrich, seules les séquences d’ARNr humain, de souris et de rat ont été utilisées pour la conception et l’optimisation des oligonucléotides de capture.
Produits accessoires : Ce kit nécessite un support magnétique. Plusieurs formats sont disponibles, notamment le support magnétique à un seul emplacement (réf. : AM10026), le support magnétique à 6 tubes (réf. : AM10055) et les supports magnétiques à 96 puits (réf.: AM10027 et AM10050). Le kit RiboPure-Bacteria (réf. : AM1925) est idéal pour la purification de l’ARN total de cellules bactériennes-hôtes. Les réactifs de traitement et d’élimination de DNase TURBO™ DNA-free™ ou DNA-free (réf. : AM1907 et AM1906, respectivement) sont recommandés pour l’analyse de biopuces et d’autres applications où l’élimination de l’ADN génomique contaminant est nécessaire. Après la procédure MICROBEnrich, l’ARNm bactérien peut être purifié à partir de l’ARN total à l’aide du kit d’enrichissement d’ARNm bactérien MICROBExpress™ (réf. : AM1905). Cette technologie permet d’éliminer >95 % des ARNr procaryotes 16S et 23S.
Non compatible avec des cadences élevées (manuel)
Purification et analyse de l’ADN et de l’ARN, extraction d’ARN, isolement d’ARN total, ARN total extrait d’échantillons bactériens
Contenu et stockage : Conserver l’ARN de contrôle, le mélange d’oligonucléotides de capture, le glycogène et le NaOAc 3M à -20°C. Conserver les microbilles magnétiques d’oligonucléotides, le tampon de liaison, la solution de lavage, la solution de régénération 1, la solution de régénération 2 et la solution de resuspension à 4°C. Conserver l’eau exempte de nucléase, les tubes de 1,5 ml et les tubes de prélèvement de 2 ml à température ambiante.
Isolation Technology : Capture d’hybridation, Microbille magnétique
Type d’échantillon : Bactéries, ARN, ARN total (mélange d’ARN bactérien-mammifères hôtes), ARN, ARN total (mélange d’ARN bactérien-mammifères hôtes)
Type de produit final : ARN total (bactérien)
Compatibilité à haut débit : Non compatible avec des cadences élevées (manuel)
À utiliser avec (application) : Analyse par biopuces
Nbre de réactions : 20 préparations
Gamme de produits : Ambion™, MICROBEnrich™
Target : ARN total
