Ce panel TrueMark™ PGx (pharmacogénomique) SNP + CNV 64 est proposé en plaques 384 puits pré-spottées, un format efficace et facile à utiliser pour les applications de pharmacogénomique. Ce panel contient 56 tests de génotypage TaqMan® DME et SNP en simple exemplaire et deux tests CNV en quadruplicat, permettant d’analyser jusqu’à six échantillons d’ADN par plaque 384 puits. Les tests ont été développés pour détecter les polymorphismes des gènes codant les enzymes du métabolisme des médicaments (DME) et les protéines de transport associées. Ce panel couvre les marqueurs essentiels et couramment étudiés de CYP2D6, CYP2C19, CYP2C9, DPYD et d’autres gènes importants de DME et de recherche clinique.
Chaque test de génotypage TaqMan Drug Metabolism et SNP du panel contient deux sondes spécifiques d’allèle et une paire d’amorces pour détecter la cible SNP spécifique. Les sondes comme les amorces s’alignent de manière unique dans le génome, ce qui confère à la technologie de génotypage TaqMan une spécificité supérieure. C’est cette spécificité qui permet à ces tests de détecter des cibles situées dans des familles de gènes très homologues pouvant inclure des pseudogènes. Chaque test de nombre de copies est associé à un test de référence TERT dans un même puits pour former un test duplex conçu pour détecter les variations du nombre de copies (CNV), telles que délétions, duplications ou allèles hybrides.
Les tests TaqMan Drug Metabolism, de génotypage et CNV ont été développés avec un haut niveau d’exigence, tant en bio-informatique qu’en laboratoire. Tous les tests ont satisfait à des essais de performance portant sur 180 échantillons d’ADN uniques issus de quatre populations différentes.
La plaque est préformatée et disponible en stock, économique, pratique et facile à utiliser, sans nécessiter de robotique coûteuse. Les résultats sont reproductibles et cohérents d’un échantillon, d’une étude et d’un laboratoire à l’autre—pour une qualité de données identique d’une plaque à l’autre et d’un lot à l’autre, même avec des opérateurs différents.
Caractéristiques techniques
| Marque | Applied Biosystems |
| Réf. B-LABO | BL-RE-178172 |
| Contenu et stockage | 15°C à 30°C |
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| Méthode de détection | TaqMan |
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| Forme | Dried Down |
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| GC-Rich PCR Performance | Moyen |
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| Méthode PCR | qPCR |
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| Vitesse de réaction | Standard |
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| Technique | qPCR |
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| Marqueur ou colorant | FAM + VIC |
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| Nbre de tests | 6 échantillons par plaque 384 puits (60 échantillons) |
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| Quantité | 10 plaques (60 échantillons) |
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| Conditions d’expédition | Température ambiante |
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| Espèces | Humain |
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| Classe d’organisme cible | Humain |
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| À utiliser avec (application) | Génotypage, analyse des variations du nombre de copies, PCR en temps réel (qPCR) |
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| Nbre de réactions | 64 réactions/échantillon |
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| Type d’échantillon | Écouvillons buccaux et sang total sur EDTA |
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| Taille (produit final) | 10 plaques |
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| Corformité aux certifications | ISO 9001 |
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