Les selles et le sol sont souvent les types d’échantillons de choix pour les scientifiques du domaine des microbiomes. Cependant, ces échantillons ont également été parmi les plus difficiles à extraire de l’ARN et de l’ADN, jusqu’à présent. Le kit d’isolement d’acide nucléique MagMAX Microbiome Ultra permet une extraction efficace et à haut débit d’acide nucléique des selles et des sols. Ce kit utilise la technologie de microbilles magnétiques MagMAX, garantissant une récupération reproductible de l’acide nucléique de haute qualité compatible avec un large éventail d’applications, notamment les biopuces, la PCR en temps réel et le séquençage de nouvelle génération. Les caractéristiques du kit d’isolement d’acide nucléique MagMAX Microbiome comprennent : • Protocoles adaptés à l’automatisation conçus pour les systèmes KingFisher Flex et KingFisher Duo Prime • La procédure rapide permet de traiter 96 échantillons en 60 minutes environ • Compatible avec les selles, les sols et les écouvillons contenus dans le milieu de transport • Perturbation mécanique par broyeur à billes dans une plaque à 96 puits ou des tubes individuels • Plages de volumes d’élution entre 50 et 200 μl Maximise l’entrée d’échantillons et la récupération d’acide nucléique en un minimum de tempsJusqu’à 100 mg de selles peuvent être traités par puits dans une plaque à 96 puits profonds KingFisher. Lorsque le processus d’extraction est effectué à l’aide d’un système KingFisher Flex, 96 échantillons peuvent être traités en 60 minutes environ ; en utilisant un système KingFisher Duo Prime, 12 échantillons peuvent être traités en 50 minutes environ. Lorsque le protocole est terminé, l’ARN pur et l’ADN sont concentrés dans 100 μl de tampon d’élution. Deux formats de broyeurs à billes disponibles Le traitement à haut débit d’échantillons difficiles tels que les selles est possible avec des plaques à 96 puits profonds contenant des billes de zirconia combinées avec des réactifs MagMAX Microbiome optimisés. Si le traitement de 96 échantillons à la fois n’est pas nécessaire, les mêmes microbilles sont disponibles en format tube pour un traitement à faible débit. Une fois l’étape de broyeur à billes terminée, le lysat peut être transféré dans une plaque à 96 puits profonds KingFisher et traité sur un système KingFisher Flex ou KingFisher Duo Prime. Avantages de la purification à base de microbilles magnétiques MagMAX Les microbilles magnétiques offrent de nombreux avantages par rapport à d’autres technologies d’isolement d’acide nucléique. L’ADN se lie plus efficacement aux microbilles qu’aux filtres en fibre de verre, ce qui permet d’obtenir des rendements plus élevés et plus constants. L’absence de filtres et de modules de dégazage permet également d’éliminer tout risque d’obstruction des filtres causée par des particules cellulaires présentes au sein des échantillons. Ce problème d’obstruction est une source de préoccupation en particulier avec des échantillons de selles qui sont couramment utilisés pour la recherche sur le microbiome. Les Dynabeads MyOne Silane contenues dans le kit d’isolement d’acides nucléiques MagMAX Microbiome Ultra possèdent une chimie de surface optimisée de type silice avec une surface hautement spécifique qui permet une cinétique efficace et une sensibilité élevée dans la capture d’acides nucléiques. Ces particularités font des Dynabeads MyOne Silane l’outil idéal pour la récupération de l’ARN et de l’ADN. Une fois capturés, ces acides nucléiques peuvent être élués dans 50 à 100 μl de tampon d’élution pour une utilisation dans des applications en aval.
Caractéristiques techniques
| Marque | Applied Biosystems |
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| Réf. B-LABO | BL-RE-088750 |
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| Réf. fabricant | 16656836 |
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| Contenu et stockage | • 80 ml de tampon de lyse, stocker à température ambiante<br>• 50 ml de solution de liaison, stocker à température ambiante<br>• 200 ml de tampon de lavage, stocker à température ambiante<br>• 4 ml de protéinase K, stocker à température ambiante<br>• 2 ml de microbilles de liaison d’ADN / ARN, stocker à température ambiante<br>• 25 ml de solution d’élution, stocker à température ambiante<br>• Plaque à broyeur de billes à 96 puits, stocker à température ambiante<br><br> |
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| Isolation Technology | Magnetic Bead |
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| Type d’échantillon | Bacteria, Biofluids, Fecal, Soil, Swabs (Buccal or Skin), Yeast |
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| Volume d’élution | 50 to 200 μL |
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| Type de produit final | RNA and DNA |
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| À utiliser avec (équipement) | KingFisher™ Duo Prime, KingFisher™ Flex, KingFisher™ Apex |
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| À utiliser avec (application) | RT-PCR, qPCR, cDNA library construction, NGS, microarray analysis, blot hybridization, Northern/Southern blotting, in vitro translation, nuclease protection assays, nucleic acid labeling, hybridization |
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| Compatibilité à haut débit | High-throughput Compatible |
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| Quantité | 100 Preps |
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| Conditions d’expédition | Température ambiante |
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| Heure du test | 60 min |
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| Quantité de matériel de démarrage | Bacteria: ≤500 μL<br>Biofluids: ≤500 μL<br>Fecal: ≤100 mg (200 μL for samples in storage solution)<br>Soil: ≤250 mg<br>Yeast: ≤500 μL |
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